有瑕疵的鉴定意见在特定条件下是可以被法院采纳，但需经过补正或合理解释，且瑕疵程度需不影响鉴定意见的科学性、客观性与合法性。‌‌核心要看瑕疵类型、能否补正及是否影响核心结论，法院会按“先补正、后排除”原则审查 。

一、核心判断标准

- 形式/轻微瑕疵（如错别字、签名盖章不规范、图表不清晰等，不影响核心结论）：可通过补正、补充鉴定、补充质证修复，修复后通常可采纳，法院一般不准许重新鉴定 。

- 实质性瑕疵（如鉴定人无资质、程序严重违法、依据明显不足、结论与其他部分矛盾、表述不确定等）：不得采纳，法院应准许重新鉴定，原鉴定意见不能作为定案依据。当事人需在举证期内书面提异议，申请重新鉴定应提交足以反驳的证据 。

- 关键前提：鉴定意见需满足真实性、合法性、关联性，且鉴定人可出庭接受质询并合理解释。

二、法院处理流程

1.审查瑕疵性质与影响，判断是否可通过补正、补充鉴定、补充质证修复。

2.可补救的，要求鉴定人补正/补充鉴定，组织补充质证。

3.无法补救或属实质性瑕疵的，不予采纳，启动重新鉴定（重新鉴定后原意见无效） 。

天纵鉴定（SKYLABS）需要补充强调的是如鉴定人拒不出庭的，鉴定意见将不得采纳。总之，最终有瑕疵的鉴定意见是否采纳取决于瑕疵的性质与影响。轻微、非关键性瑕疵经补正后可采信；而实质性缺陷或非法行为则可能导致鉴定意见被排除。